Отдел обеспечивает высококвалифицированную медико-социальную помощь детям с ВИЧ-инфекцией, являющимися пациентами ФКУ «РКИБ» Минздрава России.

Также уделяет большое внимание проведению научно-практических мероприятий по вопросам профилактики и лечения ВИЧ-инфекции, подготовке и изданию информационных, аналитических и учебных материалов, работе по обучению специалистов, занимающихся вопросами профилактики, диагностики и лечения ВИЧ-инфекции у беременных женщин и детей.